Вагоноремонтен завод гр.Септември е създаден през 1941 година като Вагоноремонтна работилница. Дейността й включва извършването на среден ремонт на пътнически и товарни вагони, с междурелсие 760мм и 1435мм. През периода 1971-1975 година се построяват халета за ремонт на пътнически вагони, които по-късно поемат ремонта на всички вагони с междурелсие 1435 мм.

С Решение на Министерството на Транспорта от м.януари 1971год. се учредява Вагоноремонтна база на пряко подчинение на Генерална Дирекция на Български Държавни железници. През 1983 година е изграден първият цех в България за ремонт и преокомплектоване на колооси.

До момента “ВРЗавод-99”-АД, гр.Септември, остава единствения завод в страната, който извършва ремонт и преокомплектоване на колооси.  През 1990 год. предприятието прераства във Вагоноремонтен завод към ж.п.промишленост на Национална Компания ”БДЖ”.На 24.06.1999 година е извършена регистрация на “Вагоноремонтен завод 99”-АД, което става правоприемник на “Вагоноремонтен завод” вследствие извършената приватизация.

Предмета на дейност на Дружеството е:

• ”Ремонт на подвижен ж.п. състав; външно и вътрешнотърговска дейност с всякакви разрешени от закона стоки, реекспорт, бартерни сделки;
• Всякакъв вид разрешена от закона производствена дейност;
• Представителство и агентство на български и чуждестранни фирми и лица,.” Като правоприемник на активите и пасивите на раздържавеното предприятие - “Вагоноремонтен завод”, цялата стопанска дейност на новорегистрираното дружество, се покрива изцяло с производствената дейност на ВР Завод.